LaTeX: Acentos y caracteres especiales en Ubuntu:

Si vamos a utilizar Ubuntu en lugar de Windows para compilar nuestros documentos de látex, tendremos que saber que Ubuntu emplea una codificación de caracteres UTF-8, así es que, al introducir la información necesaria en la cabecera del documento (definimos la clase del documento), en Ubuntu tendremos que sustituir esta línea:

\usepackage[latin1] {inputenc}

por estas otras:

\usepackage {ucs}
\usepackage[utf8x] {inputenc}
\usepackage[spanish] {babel}

Fuentes:

Caracteres especiales (Página de inforlandia)